Do ảnh hưởng của bão số 3, tuyến đường sắt Hà Nội- Lào Cai hư hỏng nặng nề; 15 vị trí bị cây, cột thông tin đổ vào đường sắt; nhiều điểm nước ngập sâu, chảy xiết gây xói lở nền đá, nền đường, sạt lở taluy nền đường, đất đá trôi lấp nền đường, rãnh đường sắt (có khoảng 20 điểm ngập nước và trên 45 điểm sạt lở nền đường).
Ngoài ra, còn khoảng 15 điểm cây xanh, vật kiến trúc gãy đổ vào tuyến đường dây thông tin tín hiệu đường sắt. Ngập 12 tủ đường ngang có người gác, hư hỏng thiết bị giám sát, khoảng 24 bình ắc quy đã phóng kiệt dung lượng. Thiết bị tín hiệu tại ga Yên Bái bị ngập nước, do nước dâng nhanh nên một số thiết bị như đài khống chế, máy phát điện và một số thiết bị ngoài trời không kịp tháo dỡ, di dời.
Đến ngày 14/9, tuyến đường sắt vẫn tê liệt, 18 chuyến tàu phải hủy bỏ do ảnh hưởng bão số 3.
Lãnh đạo Công ty CP Đường sắt Yên Lào cho biết, toàn địa bàn công ty quản lý từ Yên Bái lên đến Lào Cai có 47 điểm bị ngập, sạt. Các điểm đều được khắc phục với tinh thần sự cố ở đâu, khắc phục ngay tại đó để nhanh chóng thông đường.
Duy điểm cuối cùng là tại Km162 (xã Nga Quán, huyện Trấn Yên, tỉnh Yên Bái) bị mưa ngập trên 2m. Sau khi nước rút, lớp bùn ngập cao 60cm che toàn bộ đường sắt, dài hơn 1km. Công ty CP Đường sắt Yên Lào đã huy động nhân lực tập trung khắc phục để khắc phục nhanh, thông đường toàn tuyến.
Đến gần 10h40 sáng nay, khắc phục xong điểm nặng nhất Km162, trả đường, thông toàn tuyến cho tàu chạy qua 5km/h. Ngay sau khi thông tuyến, đoàn tàu chở hàng cứu trợ từ các tỉnh phía Nam đi ra đã khởi hành.
Ông Đặng Sỹ Mạnh, Chủ tịch Hội đồng thành viên Tổng công ty Đường Sắt Việt Nam cho biết, đây mới chỉ là khắc phục bước 1 để thông đường. Sau đây đường sắt sẽ tiếp tục kiểm tra, đánh giá để có phương án sửa chữa tiếp theo.