Nhằm tạo thuận lợi cho người nộp thuế trong việc thực hiện nghĩa vụ kê khai thuế, đồng thời góp phần tích cực vào công cuộc cải cách thủ tục hành chính nói chung và thủ tục thuế nói riêng, năm 2010, Tổng cục Thuế đã trình Bộ ban hành Thông tư giao dịch điện tử trong lĩnh vực thuế làm cơ sở pháp lý để người nộp thuế đăng ký, khai, nộp thuế điện tử.

Việc khai thuế qua mạng Internet bằng chữ ký số được thực hiện đơn giản chỉ với vài click chuột, không giới hạn số lần gửi 1 tờ khai, không giới hạn về thời gian, tiết kiệm chi phí cho doanh nghiệp…

Tuy nhiên, theo Cục thuế thành phố Hà Nội, trên thực tế, đã có các trường hợp chậm nộp hồ sơ khai thuế qua mạng so với thời hạn quy định và phải lập biên bản vi phạm hành chính về thuế.

Trường hợp người nộp thuế không nộp hồ sơ khai thuế, cơ quan thuế căn cứ thông tin tiếp nhận nộp hồ sơ thuế điện tử và các thông báo đôn đốc nộp hồ sơ khai thuế đã gửi cho người nộp thuế qua Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế để lập biên bản xử phạt vi phạm hành chính.

Thực tế khi đăng ký kê khai qua mạng và nộp thuế điện tử, các đơn vị, tổ chức đều phải đăng ký một địa chỉ email nhận các thông báo của cơ quan thuế.

Theo đó, Cục thuế thành phố Hà Nội khuyến cáo người nộp thuế cần thường xuyên kiểm tra thư điện tử theo địa chỉ thư điện tử đã đăng ký với cơ quan thuế, đăng nhập tài khoản giao dịch thuế điện tử trên Cổng thông tin điện tử của Tổng cục Thuế để tra cứu, xem, in thông báo, văn bản cơ quan thuế đã gửi cho người nộp thuế.

Ngoài ra thực hiện nộp hồ sơ khai thuế sớm so với quy định nhằm tránh trường hợp để sát ngày nộp không thành công dẫn đến bị phạt vi phạm hành chính về việc chậm nộp tờ khai thuế qua mạng.